Cappella di S. Isidoro
Edificata nel 1683, anno della canonizzazione di S. Isidoro agricoltore, si deve alla munificenza di Mons. Diego Fernandez de Angulo o.f.m., arcivescovo di Cagliari e Vicere di Sardegna, il cui monumento funebre è situato nella parte centrale bassa della Cappella. Sempre in posizione centrale ma più in alto rispetto al monumento del committente, spicca un raffinatissimo quadro, collocato fra quattro colonne a spirale in marmo nero, e raffigurante una Madonna con Bambino. L'opera è stata attribuita ad un celebre esponente del classicismo settecentesco romano, Carlo Maratta; dinanzi a questo dipinto Gli Stamenti o il Parlamento sardo giuravano fedeltà all'Immacolata Concezione di Maria. Infine merita un accenno pure la deliziosa statua di San Saturnino, in legno dorato e policromato, realizzata da Giuseppe Antonio Lonis nel 1759. 

Cappella aragonese del SS. Sacramento
È posteriore al 1326 e quindi successiva alla conquista del Castello da parte degli Aragonesi come dimostrano la pianta semiottagonale della Cappella e lo stemma aragonese, presente sia nei capitelli d'imposta che nella gemma anulare della volta. Il tipico stile gotico- catalano è ben documentato dalla volta a crociera e dalla bifora elegante a sesto acuto. Attualmente la Cappella ospita il prezioso Tabernacolo del 1610, commissionato dall'Arcivescovo Francisco d'Esquivel. Nella parte alta è situata la lampada pensile del Mameli e sui lati i due enormi blandoni, realizzati da un gruppo misto di artisti sardo - siculi nel 1648. 

 

Cappella della Madonna delle Grazie.
Questa cappella è situata a fianco di quella trecentesca aragonese, sul lato destro del presbiterio.